Dalam projek pemisahan khas, teknologi membran rawatan air terutamanya digunakan untuk kepekatan bahan, rawatan air sisa pewarna, dan pemisahan protein dalam biopharmaceuticals. Membran nanofiltrasi dan teknologi elektrodialisis memainkan peranan dalam pemisahan selektif dalam bidang ini, seperti nanofiltrasi untuk pemisahan bahan dengan perbezaan berat molekul dan elektrodialisis untuk menangani pemulihan asid dan alkali. Pembersihan hiliran dalam biopharmaceuticals memerlukan ultrafiltrasi dan mikrofiltrasi untuk menghilangkan virus atau serpihan selular untuk memastikan kesucian dan keselamatan produk.